MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Symbiobacterium thermophilum IAM 14863 chromosome

Total Repeats: 10271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006177	CGC	2	6	1398	1403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_006177	CG	3	6	1416	1421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006177	CG	3	6	1560	1565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_006177	AGGG	2	8	1586	1593	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006177	TGA	2	6	4400	4405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006177	GGA	2	6	4407	4412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006177	GAG	2	6	6396	6401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006177	CCT	2	6	8862	8867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_006177	AAG	2	6	8872	8877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006177	AG	3	6	8888	8893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006177	AG	3	6	8976	8981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006177	CGG	2	6	8983	8988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_006177	GTGG	2	8	9080	9087	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006177	GGC	2	6	9145	9150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006177	GCGCG	2	10	9185	9194	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_006177	GTCCC	2	10	9235	9244	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_006177	GC	4	8	9259	9266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_006177	GGGGC	2	10	9283	9292	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
19	NC_006177	CCG	2	6	10503	10508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_006177	TCG	2	6	10530	10535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_006177	CGG	2	6	10555	10560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006177	AGG	2	6	10606	10611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006177	GGGA	2	8	12255	12262	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006177	CGG	2	6	12320	12325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006177	GAG	2	6	12366	12371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006177	CG	3	6	13663	13668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_006177	CG	3	6	13673	13678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_006177	GC	4	8	13698	13705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_006177	CGG	2	6	13715	13720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006177	TAT	2	6	13734	13739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006177	AGC	2	6	13814	13819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_006177	CCAC	2	8	13879	13886	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_006177	CGC	2	6	13903	13908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_006177	AGG	2	6	13914	13919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006177	GGAT	2	8	14388	14395	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006177	C	6	6	14436	14441	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_006177	G	6	6	14454	14459	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006177	GC	3	6	18917	18922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_006177	CCG	2	6	19105	19110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_006177	TGAGGC	2	12	19126	19137	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_006177	GGT	2	6	19146	19151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006177	TTG	2	6	19188	19193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006177	GGA	2	6	19200	19205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006177	GAG	2	6	19212	19217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006177	GGGC	2	8	20730	20737	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_006177	CCGC	2	8	20750	20757	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_006177	CCG	2	6	20773	20778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_006177	GCCC	2	8	20851	20858	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_006177	GTC	2	6	20944	20949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006177	AT	3	6	21028	21033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006177	GCCA	2	8	21038	21045	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006177	GCG	2	6	21061	21066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006177	AG	3	6	21096	21101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006177	CGAG	2	8	21108	21115	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_006177	GGC	2	6	21183	21188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006177	GCG	2	6	21243	21248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_006177	CTCTG	2	10	21279	21288	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_006177	AGG	2	6	21382	21387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006177	CCA	2	6	21425	21430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_006177	CGA	2	6	21434	21439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_006177	GCA	2	6	21508	21513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006177	GCA	2	6	21548	21553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006177	CGC	2	6	21555	21560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_006177	GAA	2	6	21567	21572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006177	GAA	2	6	21604	21609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006177	CAG	2	6	21676	21681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_006177	GGC	2	6	21741	21746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006177	GGA	2	6	21867	21872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006177	GGC	2	6	21887	21892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006177	TG	3	6	21986	21991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006177	C	6	6	22003	22008	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_006177	AGC	2	6	22096	22101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_006177	CT	3	6	22186	22191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_006177	GGT	2	6	22213	22218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006177	GTC	2	6	22227	22232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006177	TCGTG	2	10	22236	22245	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_006177	GGA	2	6	22341	22346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006177	ATC	2	6	22365	22370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006177	AC	3	6	22392	22397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_006177	GAGC	2	8	22418	22425	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_006177	GGGA	2	8	22439	22446	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006177	AC	3	6	22560	22565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_006177	GCC	2	6	22629	22634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_006177	CCT	2	6	22703	22708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_006177	AC	3	6	22903	22908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_006177	AAG	2	6	22914	22919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006177	CGG	2	6	22953	22958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_006177	GAG	2	6	23106	23111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006177	GCG	2	6	23178	23183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_006177	GAG	2	6	23194	23199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006177	GGCC	2	8	23286	23293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_006177	G	6	6	23383	23388	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006177	ACC	2	6	23389	23394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_006177	GTGC	2	8	23531	23538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_006177	GAA	2	6	23544	23549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006177	AAGCGA	2	12	23604	23615	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_006177	CGT	2	6	23939	23944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_006177	AGC	2	6	24044	24049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006177	CAT	2	6	24050	24055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_006177	GCG	2	6	24173	24178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006177	ACC	2	6	24369	24374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_006177	AGG	2	6	24404	24409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006177	CCG	2	6	24472	24477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_006177	CCGA	2	8	24499	24506	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_006177	GA	3	6	24601	24606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006177	GA	3	6	24697	24702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006177	CGC	2	6	24703	24708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_006177	AGAGG	2	10	24727	24736	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006177	CGG	2	6	24878	24883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006177	TGG	2	6	25075	25080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006177	ACC	2	6	25149	25154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_006177	GCA	2	6	25158	25163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_006177	CCT	2	6	25237	25242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_006177	ATC	2	6	25288	25293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_006177	GACA	2	8	25330	25337	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_006177	CGG	2	6	25372	25377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_006177	CGT	2	6	25568	25573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006177	GGA	2	6	25604	25609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006177	TG	3	6	25884	25889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006177	TG	3	6	25895	25900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006177	CTT	2	6	26035	26040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006177	ATC	2	6	26067	26072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_006177	GGC	2	6	26253	26258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_006177	CCG	2	6	26318	26323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_006177	CTC	2	6	26403	26408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_006177	CCA	2	6	26495	26500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_006177	TCC	2	6	26574	26579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_006177	CCA	2	6	26585	26590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_006177	GCG	2	6	26770	26775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_006177	CGC	2	6	26778	26783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_006177	GAG	2	6	26797	26802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006177	GCC	2	6	26832	26837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_006177	GTG	2	6	26878	26883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006177	CAC	2	6	27120	27125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_006177	AGC	2	6	27165	27170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_006177	CAG	2	6	27182	27187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_006177	CCA	2	6	27207	27212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_006177	TGT	2	6	27344	27349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006177	CCG	2	6	27354	27359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_006177	CG	3	6	27364	27369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_006177	GCC	2	6	27378	27383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_006177	GC	3	6	27427	27432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_006177	AGG	2	6	29223	29228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006177	GCA	2	6	31016	31021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_006177	CGT	2	6	31051	31056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_006177	GAAG	2	8	31069	31076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006177	AGG	2	6	31116	31121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006177	GCGGT	2	10	31176	31185	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
149	NC_006177	AGC	2	6	31380	31385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_006177	AGA	2	6	31399	31404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_006177	GCC	2	6	32825	32830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_006177	CCT	2	6	32832	32837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_006177	C	6	6	32882	32887	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
154	NC_006177	CAT	2	6	32913	32918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_006177	GCG	3	9	34428	34436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_006177	CGC	2	6	34473	34478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_006177	C	6	6	34502	34507	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
158	NC_006177	CAA	2	6	35363	35368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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160	NC_006177	GC	3	6	36988	36993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_006177	TGT	2	6	37246	37251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_006177	CGC	2	6	37761	37766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_006177	CGG	2	6	37830	37835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_006177	GC	3	6	37841	37846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
165	NC_006177	AGG	2	6	37852	37857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_006177	CG	3	6	39182	39187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
167	NC_006177	GCC	2	6	39243	39248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_006177	CGG	2	6	39263	39268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_006177	CGC	2	6	40151	40156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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171	NC_006177	GCT	2	6	40191	40196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_006177	CTG	2	6	40204	40209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_006177	CCG	2	6	41624	41629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_006177	CG	3	6	41636	41641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
175	NC_006177	GCT	2	6	41679	41684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_006177	CGC	2	6	41868	41873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
177	NC_006177	CCG	2	6	41879	41884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
178	NC_006177	CGA	2	6	41887	41892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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180	NC_006177	GGGA	2	8	44202	44209	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
181	NC_006177	AC	3	6	46713	46718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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183	NC_006177	GT	3	6	49094	49099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
184	NC_006177	GC	3	6	49146	49151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
185	NC_006177	GCA	2	6	49185	49190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_006177	CG	3	6	49197	49202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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194	NC_006177	CCGG	2	8	51596	51603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
195	NC_006177	TGT	2	6	52978	52983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_006177	G	6	6	101388	101393	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
285	NC_006177	CGC	2	6	103064	103069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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287	NC_006177	AAC	2	6	104314	104319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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289	NC_006177	CGG	3	9	104415	104423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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422	NC_006177	GGC	2	6	146710	146715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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429	NC_006177	AG	3	6	146884	146889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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